面對控告，主耶穌要接受兩次主要的審判：在猶太領袖前受宗教的審判；在羅馬政權下受民事的審判。本段經文記載耶穌受到猶太教宗教的審訊，時間是周四深夜，也就是已經進到周五的時序。

1. 耶穌在該亞法面前受審（57-62節）

歸納四卷福音書，可見每次的審判都分為三個階段。約翰敘述的猶太人審判，耶穌首先被帶到該亞法的岳父亞那面前（約十八12-13）。馬太的敘述是從第二階段開始，那時審判是在大祭司該亞法的家中進行。公會已經在那裏聚會。
一般來說，被告人會給予時間作好準備，替自己辯護。然而不法的宗教領袖倉促審判耶穌，要趕快把祂定罪（賽五十三8），不讓祂得到公平的審判。

這晚，法利賽人、撒都該人、文士和長老組成公會（57節），漠視應當遵守的規則。他們的公會其實不應在晚上召開，也不應在猶太人的節期中召開。再者，他們根本不可以賄賂證人作假證供。
裁決死罪，必須過了當晚，第二天才可宣判。還有，除非是在聖殿範圍的大石堂聚集，否則他們的裁決就不合法。但他們迫不及待要除掉耶穌，這個猶太團體不惜鋌而走險，知法犯法。

該亞法是主持案件的法官，而公會顯然擔任陪審團和檢察官；至少這樣的組合並不按例執行。耶穌就是被告。彼得是旁觀者，他在遠處安全的地方和差役同坐，要看這事到底怎樣（58節）。
猶太領袖發現要尋找假見證控告耶穌並非易事（59節）。如果他們履行責任，依循審判程序，他們便會發現耶穌是無辜的。最後，有兩個人前來，歪曲耶穌的話說：「這個人曾說：『我能拆毀神的殿，三日內又建造起來。』」（60-61節）
根據那些證人所言，耶穌曾恐嚇說要拆毀耶路撒冷的聖殿，然後把它重建起來。其實不是如此，「耶穌回答說，你們拆毀這殿，我三日內要再建立起來。」（約二19）並非是主拆毀這殿。
猶太人是以這殿要四十六年才造成的，祂怎麼會三日內就再建立起來呢？耶穌是在預言自己的死和復活。猶太人這時竟把預言當作藉口，乘機殺害耶穌。

審判期間，耶穌不發一言，「像羊在剪毛的人手下無聲，他也是這樣不開口」（賽五十三7）。大祭司看見耶穌默然不語，便不耐煩起來。他逼祂發言，但主卻拒絕作答（62節）。

2.大祭司發誓要求耶穌承認是神的兒子（63-68節）

大祭司便對他說：「我指著永生神叫你起誓告訴我們，你是神的兒子基督不是？」（63節）根據摩西的律法，如果大祭司起誓，猶太人便要作見證（利五1）。
作為一個奉公守法的猶太人，耶穌就說：「你說的是。」祂更肯定地說自己彌賽亞的身分和神性：「然而我告訴你們，後來你們要看見人子，坐在那權能者的右邊，駕著天上的雲降臨。」（64節）
該亞法沒有錯過機會。耶穌暗示了但以理關於彌賽亞的預言，「我在夜間的異象中觀看，見有一位像人子的，駕著天上的雲而來！被領到亙古常在者面前。」（但七13）從大祭司的反應，可見他明白耶穌將自己和神當作同等（參看約五18）。

於是他就撕開祭司的衣服，表示見證人感到褻瀆（65節）。他向公會說出煽動的話，要證實耶穌有罪。當人們問及耶穌的判決，公會答道：「他是該死的。」（66節）
陪審員向被告人動武傷害祂，又吐唾沫在祂臉上（67節），並且譏諷祂，叫祂顯出基督的能力，指出打祂的是誰（68節）。審判的第二階段也隨之完結。整個程序不但不合司法規矩，而且令人髮指。

3. 彼得不認耶穌並悲痛落淚（69-75節）
彼得最黑暗的日子終於來到。他在外面院子裏坐著，一個女僕經過，說他是耶穌一夥的（69節）。彼得立刻猛然否認：「我不知道你說的是甚麼。」（70節）他走到門口，可能想逃避別人的注目。然而又有一個使女公開說他曾是同那加利利人耶穌一夥的（71節）。
這次，彼得發誓說不認得那個人（72節）。過了不多的時候，有些旁人又來說：「你真是他們一黨的，你的口音把你露出來了。」（73節）單單否認似乎不再奏效；這時，彼得發咒起誓，堅稱：「我不認得那個人！」立時雞就叫了（74節）。
慣常的雞叫聲刺破清晨的寧靜，也深深刺傷彼得的內心。這個洩氣的門徒記起主曾說的話，就出去痛哭（75節）。

各卷福音書記述彼得否認耶穌的次數時間並不一樣，似乎互相矛盾，其實不然。
馬太福音、路加福音和約翰福音這樣記述耶穌所說：「今夜雞叫以先，你要三次不認我。」（太二十六34；路二十二34；約十三38）而馬可福音就這樣預告：「雞叫兩遍以先，你要三次不認我。」（可十四30）
會有此矛盾，原因是可能雞叫不只一次，一次在晚上，一次在黎明。
此外，福音書也許記載彼得否認耶穌，一共至少六次。他在這些人面前否認基督：
（1）使女（太二十六69-70；可十四66-68）；
（2）另一個使女（太二十六71，72；十一四69，70）；
（3）旁邊站著的人（太二十六73，74；可十四70，71）；
（4）一個男人（路二十二58）；
（5）另一個人（路二十二59，60）；
（6）大祭司的一個僕人（約十八26，27）。

這些敘述都是證明彼得曾經三次否認主，正如耶穌之前告訴他的。只是不同作者所敘述的細節不同罷了。